バイオ関連サイトのリンク集 掲載内容
- 検索エンジン
- モデル生物データベース
- Journal Online
- ゲノムブラウザ
- プライマーデザイン
- モチーフ検索
- Self-schooling
- Full-length cDNA Database and CAGE
- 制限酵素を探す
Search Engine 検索エンジン
PubMed
HighWire *1
Google Scholar *2
Scirus(サイラス)*3
Genomes
Gene
Homologene
BLAST
Human BLAT Search
培養細胞/由来種・組織名索引
英辞郎 on the WEB *4
* 1 スタンフォード大学図書館が提供する論文検索サービス。
* 2 膨大な学術資料を簡単に検索できる。分野や発行元を問わず、学術出版社、専門学会、プレプリント管理機関、大学、およびその他の学術団体の学術専門誌、論文、書籍、要約、記事を検索できる。
* 3 Scirus(サイラス)は、Elsevier Scienceが提供する科学者向けの科学技術専用検索エンジン。科学的価値が最も高いものがトップにあがるように設計されている。
* 4 英辞郎 on the WEBは、株式会社アルクがウェブサイト「SPACE ALC」にて公開しているオンライン英和・和英データベース検索サービス。2013年3月5日時点のもので、英和見出項目数 = 191万、和英見出項目数 = 261万。生命科学に関する専門用語もかなり網羅されており、ブックマークしておくべき。これがあれば電子辞書がなくてもどうにかなることが多い。英文法FAQのページも勉強になる。
Journal Online
Cell
Molecular Cell
Cancer Cell
Nature
Nature Genetics
Nature Reviews Genetics
Nature Cell Biology
Science
The EMBO Journal
Genes & Development
PNAS
MCB
JBC
MBoC
JCB
Nucleic Acids Research
Nature Reviews Cancer
Cancer Research
Genome Browser ゲノムブラウザ
Ensembl Genome Browser *1
UCSC Genome Browser *2
ECR Browser *3
* 1 日本語では「アンサンブル」と呼ぶ。エクソンとイントロンの情報をわかりやすく表示してくれ、バリアントについても紹介されてたりする。
* 2 University of California Santa Cruzのゲノムインフォマティクスのグループによって管理されているブラウザ。マルチプルアラインメントの表示が見やすい。
* 3 ECRは、「Evolutionary Conserved Regions」の略。ゲノム上の進化的に保存されているDNA領域を解析し、それを視覚化することが出来る。使用方法を知るには、サイトの下部にある「ECR Browser Guide」をクリックすればよい。
Motif Search モチーフ検索
Regulatory Sequence Analysis Tools (RSAT) *1
TFSEARCH
* 1 転写因子の結合コンセンサス配列をqueryとして与え、目的のDNA配列中にそのコンセンサス配列が存在するのか調べる機能がある。
Self-schooling
Ensembl ミニコース
UCSCゲノムブラウザミニコース
NCBI BLAST チュートリアル
NCBI ミニコース 日本語版
統合TV
Full-length cDNA Database and CAGE Database
FANTOM3
CAGE Basic Viewer for Mus musculus *1
* 1 CAGE法により構築された転写開始点のデータベース。
制限酵素を探す
* 1 NEBのウェブツール。配列から酵素を検索したり、酵素名から制限部位を検索出来る。
「NEB Tools」という無料アプリあり(Android版、iOS版がある)。リンクページでも紹介されている。